Máy đo dòng xoáy thường không được khuyến khích sử dụng cho các ứng dụng trộn hoặc dòng chảy gián đoạn khác. Điều này là do cài đặt tốc độ dòng chảy nhỏ giọt của trạm trộn có thể giảm xuống dưới giới hạn số Reynolds tối thiểu của đồng hồ. Tổng số lô càng nhỏ thì khả năng xảy ra lỗi càng nghiêm trọng.

Khí áp suất thấp (mật độ thấp) không tạo ra xung áp suất đủ mạnh, đặc biệt nếu vận tốc chất lỏng thấp. Do đó, có khả năng là trong các dịch vụ như vậy, phạm vi hoạt động của đồng hồ sẽ kém và dòng chảy kiệt sẽ không thể đo được. Mặt khác, nếu chấp nhận được phạm vi đo giảm và đồng hồ đo có kích thước chính xác cho dòng chảy bình thường thì vẫn có thể xem xét lưu lượng kế xoáy.

Nếu chất lỏng trong quá trình có xu hướng bao phủ hoặc tích tụ trên phần thân vô tội vạ, như trong dịch vụ bùn và bùn, điều này cuối cùng sẽ làm thay đổi hệ số K của đồng hồ. Lưu lượng kế loại bỏ xoáy không được khuyến khích cho các ứng dụng như vậy. Tuy nhiên, nếu chất lỏng bẩn chỉ có lượng chất rắn không phủ vừa phải thì ứng dụng này có thể được chấp nhận. Điều này đã được chứng minh bằng thử nghiệm 2-năm trên bùn đá vôi. Khi kết thúc thử nghiệm, hệ số K được phát hiện chỉ thay đổi 0,3% so với hiệu chuẩn ban đầu tại nhà máy, mặc dù phần thân và ống dòng chảy có vết sẹo và rỗ nghiêm trọng.

Khi đo dòng chảy nhiều pha (các hạt rắn trong khí hoặc chất lỏng; bọt khí trong chất lỏng; các giọt chất lỏng trong khí), độ chính xác của máy đo xoáy sẽ giảm do máy đo không có khả năng phân biệt giữa các pha. Hơi ướt, chất lượng thấp là một trong những ứng dụng như vậy: pha lỏng phải được phân tán đồng nhất trong hơi và tránh các dòng chảy thẳng đứng để tránh hiện tượng trượt. Khi ống nằm ngang, pha lỏng có khả năng di chuyển ở đáy ống và do đó khu vực bên trong của ống phải được giữ ở phía dưới mở. Điều này có thể đạt được bằng cách cài đặt phần thân vô tội vạ theo chiều ngang. Độ chính xác của phép đo trong các ứng dụng như vậy là khoảng 5% lưu lượng thực tế nhưng có độ lặp lại tốt.

Tổn thất áp suất vĩnh viễn qua máy đo xoáy bằng khoảng một nửa so với tấm lỗ, khoảng hai đầu vận tốc. (Đầu vận tốc được định nghĩa là V2/g, trong đó V là vận tốc dòng chảy và g là hằng số hấp dẫn theo đơn vị nhất quán.) Nếu đường ống và đồng hồ có kích thước phù hợp và có cùng kích thước, độ giảm áp suất có thể chỉ ở mức một vài psi. Tuy nhiên, việc giảm kích thước (lắp đặt đồng hồ đo kích thước nhỏ hơn kích thước đường dây) để tăng Reynolds có thể làm tăng tổn thất cột áp lên hơn 10 psi. Người ta cũng phải đảm bảo rằng áp suất tĩnh mạch chủ không giảm xuống dưới áp suất hơi của chất lỏng xử lý vì điều đó sẽ gây ra hiện tượng xâm thực. Đương nhiên, nếu áp suất ngược trên đồng hồ đo thấp hơn áp suất hơi, chất lỏng xử lý sẽ nhấp nháy và chỉ số đồng hồ sẽ không có ý nghĩa.